Заказник расположен на территории Междуреченского района в бассейне р. Бельсу на западных склонах Кузнецкого Алатау. Центр заказника находится в районном центре – г. Междуреченск. Площадь заказника «Бельсинский» составляет 77334 га.

Рельеф заказника гористый, максимальные высоты достигают 2178 м над уровнем моря. Заказник расположен в среднегорном поясе темнохвойной тайги с преобладанием пихты и кедра. Видовой состав охотничьих животных, обитающих на территории Бельсинского заказника, очень широк – здесь встречаются все без исключения виды копытных животных и хищников, обитающих в Кемеровской области. Обильная кормовая база привлекает сюда соболя, выдру, норку и других ценных промысловых животных. Заказник «Бельсинский» был создан в целях охраны и воспроизводства соболя, но в нем охраняется весь комплекс природы, так как здесь проходят миграционные пути копытных, в основном марала и косули; встречается лось, северный олень. Северный олень обитает на склонах гор, окаймляющих долину р. Бельсу. В реке водятся таймень, ускуч, хариус и др.

Заказник «Бельсинский» считается видовым, созданным в целях охраны и воспроизводства соболя.

Комплексное экологическое обследование государственного зоологического заказника «Бельсинский», проведенное в 2008 г. показало, что флора и фауна исследованной территории не отличается повышенным биологическим разнообразием. Вместе с тем на этой территории обитает значительное число ценных и редких видов растений и животных.

Флора территории заказника «Бельсинский» включает 345 видов сосудистых растений, относящихся к 216 родам, 60 семействам. 10 и более видов содержат следующие семейства: астровые, мятликовые, розоцветные, осоковые, гвоздичные, лютиковые, сельдерейные, бобовые, норичниковые. По количеству родов (5 и более) выделяются семейства: мятликовые, розоцветные, лютиковые, сельдерейные, бобовые, лилейные, яснотковые, гречишные.

Выявлено 18 видов, включенных в Красную книгу Кемеровской области.

Фауна заказника достаточно разнообразна, особенно хорошо представлены основные охотничье-промысловые виды зверей. По предварительным данным, здесь обитает 164 вида позвоночных, из них 14 видов рыб, 2 вида амфибий, 1 вид рептилий, 99 видов птиц и 46 видов млекопитающих.

На данной территории обитают виды, занесенные в Красную книгу Кемеровской области: рукокрылые, тундряная куропатка, кабарга и северный олень.

Данная территория перспективна для сохранения редких крупных зверей (выдра, северный олень, кабарга) и птиц (чёрный аист, филин, тундряная куропатка).

Заказник «Бельсинский» совместно с заповедником «Кузнецкий Алатау» выполняют важную функцию по сохранению горных и таёжных экосистем, а также отдельных видов редких и хозяйственно ценных растений и животных.

Здесь расположены «Поднебесные Зубья» – район, активно посещаемый туристами. Территория Бельсинского заказника практически не затронута хозяйственным освоением, в том числе здесь не проводились рубки леса в промышленных масштабах. Негативное влияние оказывают только многочисленные группы «диких» туристов, как водников, так и пеших.